分離純粹少量目標細胞,以單細胞精準檢測基因組失衡,用以揭示霍奇金淋巴瘤(classical Hodgkin lymphoma, cHL)患者間異質性
目標細胞稀少且不易分離
古典霍奇金淋巴瘤(classical Hodgkin lymphoma, cHL)是一種B細胞來源的淋巴增生性疾病,其特徵是在型態上有霍奇金和里德-斯特恩伯格的惡性細胞(Hodgkin and Reed–Sternberg (HRS) cells)。HRS 細胞源自B細胞的生發中心,僅佔其中的一小部分(通常<5%),占比稀少;又分散在富含各式免疫細胞的環境中,難以被分離。
HRS細胞與疾病晚期階段相關
HRS細胞有特殊機制,可以避免免疫細胞的攻擊,成功逃脫。包括過度表達程序性細胞死亡蛋白1(PD-1)配體(PD-Ls)。然而,PD-L 基因座擴增與疾病的晚期階段有關。所以HRS細胞的基因表現,可以用於發展新療法與預測疾病的生物指標。
DEPArray™由FFPE樣品中精確分離HRS細胞,完成單細胞基因檢測流程
需建立完整且優化的工作流程,包括樣品的製備,使用 DEPArray™ 從FFPE樣品中分離出<5%且分散的HRS細胞,接續 Ampli1™ WGA Kit 單顆細胞全基因組擴增套組,成功完成 CNV 基因分析(使用 Ampli1™ LowPass Kit 染色體非整倍體和拷貝數變異 建庫套組)。
臨床應用
未來將進行更廣泛的研究,以評估病人間HRS細胞異質性的程度,具有潛在臨床意義,可用於發展腫瘤生物標誌物,與提供治療方案的參考。
Ampli1™ LowPass Kit
染色體非整倍體和拷貝數變異 建庫套組
接續 Ampli1™ WGA Kit 產物使用 Ampli1™ LowPass Kit,可輕鬆完成測序前建庫,免除中間複雜的實驗流程,像是純化,去掉 adaptor,再接合等步驟。