論文出處

IEEE Transactions on Signal Processing
( Volume: 66 , Issue: 20 , Oct.15, 15 2018 )
Cell Detection by Functional Inverse Diffusion and Non-negative Group Sparsity
Part I: Modeling and Inverse Problems
Part II: Proximal Optimization and Performance Evaluation

論文簡介

KTH皇家理工學院博士候選人Pol del Aguila Pla和JoakimJaldén教授撰寫的兩篇科學出版品中提出了一種新的框架和方法,用來分析來自某些基於圖像的生物化學分析的數據,例如ELISPOT和Fluorospot分析。

在第一部分中,首先介紹物理偏微分方程(PDE , partial differential equations)模型,採集生化分析所產生的圖像。然後,使用PDE的格林函數來獲得所獲取圖像的新穎參數化。該參數化允許功能優化以解決反向擴散。

特別的是,文中提出了非負群稀疏正則化優化問題,其目的是定位和表徵所述測定中涉及的生物細胞。並繼續提出一種合適的離散化方案,該方案能夠生成合成數據和可實現的演算法,以解決反向擴散問題。文中通過對方法結果和專家人工判讀數據的結果進行初步比較來結束第一部份。

第二部分致力於提供加速的近端梯度算法來解決所提出的問題以及方法的經驗驗證。

原理介紹

技術開發應用

rawspot relative amount

教授與公司合作將此影像分析演算法開發成Rawspot™技術。利用現代影像卡增強的處理能力,創新RAWspot™技術為每個點提取三維體積,對應於分泌的分析物的相對量。這種新的點數據維度稱為相對點數量(RSV)。還可以精確精確定義點的中心,確保真實的光分頻多工。

ELISpot和FluoroSpot的應用

rawspot elispot

與分析2D的8位圖像(如JPEG或TIF)相比,RAWSpot™技術可處理圖像RAW信號的動態範圍。圖像RAW直接表示來自相機傳感器的未壓縮信號,因此避免了過度飽合點的問題。 即使有數千個斑點,無論是使用ELISpot還是FluoroSpot,進行單色或是多色分析,RAWspot™技術都能始終如一地準確檢測每個斑點。

整合技術與軟體操作介面

apex overlook

為了充分利用 RAWspot™ 技術的強大功能和準確性,創建了 Mabtech Apex™ 軟體。軟體由應用科學家設計,以滿足當今對功能和操作人性化的高標準,運作快速且易於使用,並具有優化的操作設置。

新世代影像分析儀器

iris front

Mabtech 與 KTH 皇家理工學教授和瑞士機械工程師合作,2018推出 Mabtech IRIS™,整合軟硬體應用在 ELISpot 和 FluoroSpot 的實際分析上,配備可見光+ 4色螢光 (FITC ,Cy3, Cy5, DAPI) ,使用 RAWspot™ 技術確保真實光分頻多工 ,開啟影像分析的新世代。

Mabtech IRIS™更多資訊

support iris

Mabtech IRIS™ 是採用3D影像判讀分析 ELISPOT / FluoroSpot,別於傳統技術,更精確,更具優勢。現在您可以立即與我聯絡,取得 Mabtech IRIS™ 更多資訊。