DEPArray™ FFPE Sample Prep Kit FFPE樣品製備套組
FFPE樣品製備試劑套組,可完成FFPE組織蠟塊樣本去蠟回水、抗原回復、細胞單顆化與免疫螢光染色等步驟,接續以 DEPArray™ NxT 進行目標細胞分選。
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FFPE 樣本可在室溫下長期保存,數十年後仍可進行分子分析。然而,FFPE 樣本常¹因腫瘤細胞比例低 ²福馬林固定導致DNA降解或片段化,以至於分子分析結果不佳。
現今分子分析技術靈敏度以提升許多,但想取得良好的定序結果,仍須從樣品製備與細胞分選步驟著手改善。
DEPArray™ FFPE Sample Prep Kit
- FFPE 樣本細胞單顆化
- 免疫螢光染色標定 Cytokeratin 與 Vimentin
通過多種細胞樣本驗證:
人類原發/轉移性肺癌、乳腺癌、結腸癌、胰腺癌、前列腺癌和卵巢癌等 FFPE 組織切片。
產品特點
- 簡化並優化 FFPE 細胞單顆化工作流程
- 接續使用 DEPArray™系統精準分選純質癌細胞與基質細胞
- 提升特異性腫瘤細胞分子分析結果的精確性
DEPArray™ NxT FFPE 工作流程優勢
- 傳統工作流程:樣本混合腫瘤、基質或淋巴細胞DNA,無法判別真實的突變情況。
- DEPArray™ NxT:分選 100% 純質腫瘤細胞群,排除其他細胞干擾,精準呈現分子表徵。
DEPArray™ FFPE 工作流程
1.樣品製備
- FFPE Sample Prep Kit :完成FFPE 細胞單顆化與特異性免疫螢光染色。
- FFPE QC Kit:評估樣品 DNA 完整性,估算執行下游分子分析所需細胞數。
2.細胞分選與回收
3.細胞裂解
4.分子分析
- DEPArray™ OncoSeek Panel:建立NGS資料庫,分析63個常見腫瘤熱點突變。
- DEPArray™ LibPrep Kit:建立NGS資料庫,進行拷貝數變異分析。
- WES/WGS:收集足夠的細胞數亦可進行全基因組分析。
5.統計分析
- 統整測序數據並統計分析變異結果。
參考文獻
- Vasudevaraja et al, J Neuropathol Exp Neurol 2020, “Somatic Focal Copy Number Gains of Noncoding Regions of Receptor Tyrosine Kinase Genes in Treatment-Resistant Epilepsy“