DEPArray™ FFPE QC Kit FFPE樣品質量控管套組

DEPArray™ LysePrep Kit可以一次裂解高達1500個細胞,釋放DNA,可以直接進行後續定序分析(例如Targeted PCR, NGS)。一步驟單管完成細胞裂解,無需轉移樣品或清洗,降低損失或稀釋DNA;細胞裂解後可直接使用在後續應用,高敏感度和正確性。

原廠介紹

FFPE樣品會使用福馬林固定,引起DNA的斷裂或是化學修飾改變,都使得DNA質量下降,對後續定序分析造成影響。
FFPE樣品質量控管套組(DEPArray™ FFPE QC Kit) 可以從細胞裂解液中偵測所含的DNA質量,加上DEPArray分選細胞時可獲得染色體倍數的資料,搭配之後還可以計算出分選細胞數量足後進行後續定序,節省細胞用量,穩定定序結果。

擴增片段比值推斷DNA質量

原理為設計兩對引子,分別可以擴增54 bp和132 bp兩個片段,利用兩片段的比值即可獲得DNA質量的分數。

  • DNA越完整,比值越趨近1
  • DNA質量越差,比值就小於1

搭配DEPArray可知染色體倍數數值,可計算出所需定序的細胞數

  • 可根據圖表與試劑中的計算公式,得知使用多少細胞數可以得到可分析的定序結果。