產品特點
Ampli1™ WGA是唯一『非隨機』的人類單細胞全基因組擴增方法,提供強大且具再現性的擴增效率,與其它方法相比可達最低的等位基因丟失 (ADO) 率,不會丟失任何重要的遺傳數據。
1. Binder, V. (2014). A New Workflow for Whole-Genome Sequencing of Single Human Cells. Human Mutation, 35(10), 1260–1270.
2. Huang, L. (2015). Single-Cell Whole-Genome Amplification and Sequencing: Methodology and Applications. Annual Review of Genomics and Human Genetics, 16(1),
79–102.
3. Babayan, A. (2016). Comparative study of whole genome amplification and next generation sequencing performance of single cancer cells. Oncotarget, 8(34), 56066–56080.
4. Borgström, E. (2017). Comparison of whole genome amplification techniques for human single cell exome sequencing. PLOS ONE, 12(2), e0171566.
5. Normand, E. A. (2016). Comparison of three whole genome amplification methods for detection of genomic aberrations in single cells. Prenatal Diagnosis, 36(9), 823–830.
主要優勢
- 強大且具再現性
單管操作、無沉澱步驟,減少模版丟失風險。
- 最低 ADO 率
單一且高特異性引子介導的 PCR 方法,確保平均放大兩個等位基因。
- 快速流程
兼容高通量的自動化設備 (例如 Hamilton Starlet);擴增過程僅需四小時,其中手操作時間不到一小時。
- 雙股 DNA 產物
無須額外雙股合成反應。
- 擴增噪值低
沒有嵌合偽影,提供可信且乾淨拷貝數圖譜。
- 基因覆蓋度廣
提供更高的一致性。
技術原理
▲ 特定限制酶切位搭配單一引子進行PCR擴增,達到穩定且高再現性的擴增效果。
細胞裂解後,限制酶消化DNA再將DNA片段接上adaptors。確保所有的基因座和相關等位基因都被擴增,因DNA片段長度和GC含量幾乎相同,可大幅減少因原始DNA分子差異擴增而導致等位基因丟失。
樣本類型
- 起始 DNA 為 1~1000 cells/~1ul PBS
- 適用新鮮/活細胞或固定細胞 (PFA2%, CellSave, CellRescue tubes)
- 適用10ng genomic DNA (例如新鮮組織或 FFPE 樣本)
WGA產物
兼容許多不同的下游分析應用,例如 Sanger、NGS、microsatellite 或其它 PCR 相關的基因分型分析、metaphase CGH、array CGH 和 genome‐wide copy number analysis by NGS。
⋙原廠連結 Ampli1 Whole Genome Amplification