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從real-time PCR到microarray,從Sanger sequencing到NGS,各類的分子層級分析技術讓人們能更了解細胞DNA情況並廣泛用於各種領域。然而,很多情況下,樣品的來源相當稀少,例如CTCs或其他稀少臨床檢體,此時樣品的DNA量將會限制其可應用的分析方向,沒有足夠的DNA量,即無法進行後續NGS等分子分析,或是同一個樣品的DNA量無法進行多種分子分析;當無更多樣品來源時,為了突破窘困,就需要以放大現有樣本的DNA量的方式滿足分析需求,因應於此,全基因組擴增技術(Whole Genome Amplification, WGA)的重要性日漸突出。

伴隨著研究深入,樣品量從實驗室細胞培養的數百萬細胞到臨床樣本的少量細胞,經由WGA的幫助,少量細胞也可進行多樣化的後續分子分析並應用於疾病診斷等,隨著研究的精細度越來越高,最終達至單顆細胞層級的分子分析,然而為了進行單顆細胞分析,從WGA開始至分子分析結束為止的工作流程中,許多新的問題需要考量並被解決,才能成功取得有意義的單顆細胞基因組分析結果。

為了建立適當的單顆細胞基因組分析流程,以下將分析幾點於開始實驗前需考量的部分,藉此能更清楚如何選擇適當的WGA,並取得良好的單顆細胞基因組擴增產物進行後續分子分析。

DEPArray NxT side 300x300 1
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DEPArray NxT
單細胞分離篩選系統

隨著 DEPArray™ 技術的發展,基因的異質性研究可達單顆細胞層級。可探索每顆細胞基因中隱藏的故事,例如整倍體的基因變異。DEPArray™ 技術可依細胞表型分選,以及運用不同參數組合與影像系統的雙重確認,可確保分選出純度 100% 的標的細胞,採用高純度細胞故可觀察出等位基因表現。

Ampli1 WGA Kit 450 1
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Ampli1 WGA Kit
單顆細胞全基因組擴增套組

單顆細胞中使全基因組擴增優化,單一引子進行 PCR,確保相間比例擴增 DNA 片段,平均且完整擴增 DNA 片段,擴增長度 0.2~2K bp 適用任何種類的細胞,單管操作,無需沉澱 DNA,滅少損失,過程快速,手動操作時間 1.5 小時,單顆細胞最多可獲得 4ug DNA 適用於後續的基因分析應用,包括全基因組定序。